Ruby 1.9でeval_jump.hとeval_method.hにある
RDocがmake rdocで処理されないままになるようです。

とりあえずの対処としては
.docmentに*.hを加え、
common.mkのrdocのオプションに
-E h=cを加えるというので
処理対象に含めることができるようでした。

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ay