山本です。

>でした。念のため、--disable-install-doc のない場合も計測してみます。

--disable-install-doc の有無による速度差はありませんでした。あと、関係ないかもしれませんが、
ファイルシステムは FAT32 で、パーティションの大きさは 2GB、クラスタサイズは 4KB です。